promoter¶

DescriptionDentro del modelo de RegulonDB, Promoter representa una colección que permite representar los diferentes atributos y características que permiten describirlo.

Attributes

2.1_id

Type: objectId
Synonyms: [value]
Usage: [requerido, opcional]
Example:
```
Example
```
Comments: [value]

2.2 regulondbId

Type: string
Synonyms: [value]
Usage: requerido
Example:
```
RDBECOLIPR00001
```
Comments: [value]

2.3 name

Type: string
Synonyms: [value]
Usage: requerido
Example:
```
ycgZp
```
Comments: [value]

2.4 strand

Type: string
Synonyms: [value]
Usage: requerido
Example:
```
forward
```
Comments: El valor del campo strand puede estar asociado a dos valores: forward o reverse.

2.5 pos1

Type: double
Synonyms: [value]
Usage: opcional
Example:
```
1215752
```
Comments: [value]

2.6 sequence

Type: string
Synonyms: [value]
Usage: opcional

Example:

gcaaaaaattaatttatcattctgtacacatatttcgtacaagtttgctattgttacttcActtaacattgattaacattt

Comments: ^[ATCGatcg]+$

2.7 sigmaFactor
Type: string
Synonyms: [value]
Usage: opcional
Example:
```
Example
```
Comments: [value]

2.8 note
Type: string
Synonyms: [value]
Usage: opcional
Example:
```
Example
```
Comments: [value]

2.9 internalComment

Type: string
Synonyms: [value]
Usage: opcional
Example:
```
Example
```
Comments: [value]

2.10 organismId
Type: string
Synonyms: [value]
Usage: requerido
Example:
```
ECK12
```
Comments: [value]

2.11 synonyms
Type: array
Synonyms: [value]
Usage: opcional
Example:
```
Example
```
Comments: Cada elemento del arreglo debe ser único y en formato string

2.12 evidenceReferences
Type: array
Properties:

Name: publicationId Type: string Usage: opcional

Name: sourceId Type: int Usage: opcional

Name: externalDatabaseId Type: string Usage: opcional

Name: publicationUrl Type: string Usage: opcional

Name: evidenceId Type: string Usage: opcional
Synonyms: [value]
Usage: opcional

Example:

"evidenceReferences": [
  {
      "publicationId": "GID000027564",
      "sourceId": 18158297,
      "externalDatabaseId": "GID000000048",
      "publicationUrl": "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18158297",
      "evidenceId": "GID000000006"
  }
  ]

Comments: Cada elemento del arreglo debe representar un objeto único conformado con las propiedades descritas.

2.13 externalDatabases
Type: array
Properties:

Name: name Type: string Usage: requerido

Name: url Type: string Usage: requerido

Name: externaldbObjectId Type: string Usage: requerido
Synonyms: [value]
Usage: opcional
Example:
```
Example
```
Comments: Cada elemento del arreglo debe representar un objeto único conformado con las propiedades descritas.

2.14 promoterFeatures

Type: array

Properties:

Name: regulondbId Type: string Usage: opcional

Name: box10Left Type: int Usage: opcional

Name: box10Right Type: int Usage: opcional

Name: box10Sequence Type: string Usage: opcional

Name: box35Left Type: int Usage: opcional

Name: box35Right Type: int Usage: opcional

Name: box35Sequence Type: string Usage: opcional

Name: score Type: double Usage: opcional

Name: bindsSigmaFactor Type: object Usage: opcionalProperties:

  	- Name: evidenceReferences
  	- Type: array
  	- Usage: opcional
  	- Comments: Cada elemento del arreglo debe representar un _objeto_ único conformado con las propiedades que se describen a continuación.  
	-Properties:  

  			  	* Name: publicationId
				* Type: string
				* Usage: opcional  

  			  	* Name: sourceId
				* Type: int
				* Usage: opcional  

  			  	* Name: externalDatabaseId
				* Type: string
				* Usage: opcional  

  			  	* Name: publicationUrl
				* Type: string
				* Usage: opcional  

  			  	* Name: evidenceId
				* Type: string
				* Usage: opcional  

Name: evidenceReferences Type: array Usage: opcional Comments: Cada elemento del arreglo debe representar un objeto único conformado con las propiedades que se describen a continuación.Properties:

	- Name: publicationId
  	- Type: string
  	- Usage: opcional  

	- Name: sourceId
  	- Type: int
  	- Usage: opcional  

	- Name: externalDatabaseId
  	- Type: string
  	- Usage: opcional  

  	- Name: publicationUrl
  	- Type: string
  	- Usage: opcional  

  	- Name: evidenceId
  	- Type: string
  	- Usage: opcional  

Synonyms: [value]
Usage: opcional
Example:
```
Example
```
Comments: [value]

2.15 schemaVersion
Type: double
Synonyms: [value]
Usage: requerido
Example:
```
1.0
```
Comments: Este campo es utilizado de manera interna para llevar el control de las versiones del esquema de las colecciones de RegulonDB por el sistema de base de datos MongoDB.

Desing patterns

Comments:

Example:

Example